Το 1948 ιδρύθηκε το Θρησκευτικό Ορθόδοξο Ίδρυμα Αγίας Παρασκευής Κάτω Λακατάμιας, με την αλλαγή του ονόματος να πραγματοποιείται το 1969 όταν έγινε η ενοποίηση με την Ένωση Νέων Λακατάμιας. Δόθηκε το όνομα Ένωση Νέων ΘΟΪ Λακατάμιας με το καταστατικό να σημειώνει ότι σκοποί ήταν α) η ανάπτυξη του αισθήματος της αλληλεγγύης μεταξύ των μελών, β) η καλλιέργεια και διάδοση του αθλητισμού και της φυσικής αγωγής γενικά, η ανάπτυξη του αθλητισμού και της φυσικής αγωγής γενικά, η ανάπτυξη του αθλητικού πνεύματος και η σύσφιξη των φιλάθλων δεσμών και γ) η πνευματική γενικά ανάπτυξη των μελών.
Μεταξύ άλλων οι σκοποί επιδιώκονται μέσω της τέλεσης αγώνων ποδοσφαίρου. Το τμήμα ποδοσφαίρου είχε ιδρυθεί από το 1959 και δέκα χρόνια αργότερα, το 1969, συμμετείχε στα πρώτα ποδοσφαιρικά πρωταθλήματα «Επτά σε κάθε ομάδα» καταλαμβάνοντας την 1η και 2η θέση στον Κοντεμένο και την 1η στο πρωτάθλημα που διοργάνωσε το Κέντρο Νεότητος Λευκωσίας.
Το 1961 έγινε η ένταξη στο πρωτάθλημα ΕΠΟΠΛ, έναν χρόνο μετά την ίδρυση της Εθνικής Ποδοσφαιρικής Ομοσπονδίας Περιφέρειας Λευκωσίας. Στα 16 χρόνια που αγωνίστηκε στην ΕΠΟΠΛ η Ένωση Νέων ΘΟΪ Λακατάμιας κατάφερε σε δύο διαφορετικές χρονικές περιόδου, το 1972-1973 και το 1975-1976, να κερδίσει όλους τους τίτλους (πρωταθλήτρια Ομίλου, Πρωταθλήτρια Πρωταθλητριών, Κυπελλούχος).
Μετά το δεύτερο τριμπλ, ακολούθησε η ένταξη στην Γ’ κατηγορία. Η Ένωση Νέων ΘΟΪ Λακατάμιας έδωσε τον πρώτο της αγώνα στις διοργανώσεις της ΚΟΠ στις 3 Οκτωβρίου 1976 στην έδρα του, φέρνοντας ισοπαλία 3-3 με την ΑΕΚ Κυθρέας. Τη σεζόν 1982-83 αναδείχθηκε πρωταθλητής Γ’ κατηγορίας, ανεβαίνοντας για πρώτη φορά στη Β’ κατηγορία.
Η δεύτερη άνοδος στη δεύτερη τη τάξει διοργάνωση επιτεύχθηκε τη σεζόν 1991-92 ως δευτεραθλήτρια Γ’ κατηγορίας. Ενόψει της δεύτερης συμμετοχής στη Β’ κατηγορία, η Ένωση Νέων ΘΟΪ Λακατάμιας έκανε για πρώτη φορά την προετοιμασία της στο εξωτερικό και συγκεκριμένα στις εγκαταστάσεις της ΤΣΕ.ΣΕ.ΚΑ στη Σόφια της Βουλγαρίας.
Τις περιόδους 1998-99 και 1999-2000 επιτεύχθηκαν δύο διαδοχικές προκρίσεις και τίτλοι, αφού πανηγυρίστηκαν κατά σειρά τα πρωταθλήματα σε Δ’ και Γ’ κατηγορία αντίστοιχα. Στη Γ’ κατηγορία μετράει άλλο ένα πρωτάθλημα τη σεζόν 2014-15.
Προηγουμένως την περίοδο 2012-13 είχε πάρει το Κύπελλο μικρών κατηγοριών (Γ’ & Δ’), κερδίζοντας στον τελικό την ΕΝΑΔ Πόλης Χρυσοχούς με 1-0, γεγονός που την κατέστησε ως την πρώτη ομάδα Δ’ κατηγορίας που κατακτάει τον τίτλο στη διοργάνωση, που μετρούσε πέντε χρόνια ύπαρξης.
Φυσικά, ιστορική στιγμή ήταν η άνοδος της ομάδας στην Α’ κατηγορία. Τελειώνοντας αήττητη στους τελευταίους δέκα αγώνες το πρωτάθλημα της Β’ κατηγορίας τη σεζόν 2004-05, πήρε πανηγυρικά την άνοδο για τα μεγάλα σαλόνια της Α’ κατηγορίας. Συμμετείχε στο πρωτάθλημα Α’ κατηγορίας της περιόδου 2005-06, στη μοναδική της παρουσία στη μεγαλύτερη τη τάξει διοργάνωση του κυπριακού ποδοσφαίρου, κατά την οποία κατέγραψε απολογισμό μία νίκη και τέσσερις ισοπαλίες σε 26 παιχνίδια.
Η Ένωση Νέων ΘΟΪ Λακατάμιας στεγάζεται, οίκημα και γήπεδο, στην οδό Ακαδημίας αρ. 20 από τον Δεκέμβριο του 1997.
